Las Fases Extra (Expert Stages en inglés, エキストラステージ en japonés) se irán desbloqueando a medida que logre acabarse cierta cantidad de fases normales con rango S. La primera se desbloquea tras completar con S 12 fases.
Para saber la descripción de cada habilidad, revisa el apartado Habilidades & Efectos.
| Fase | Pokémon | Tipo | Tiempo | Ataque | Captura | Habilidad |
|---|---|---|---|---|---|---|
| EX1 | SiniestroSiniestroDark | 1 minuto 12 fases rango S | 60 | 1% | Despiste | |
| EX2 | EléctricoEléctricoElectric | 1 minuto 12 fases rango S | 30 | 1% | Certero | |
| EX3 | PeleaLuchaFighting | 2 minutos 12 fases rango S | 60 | 1% | Certero | |
| EX4 | HieloHieloIce | 2 minutos 20 fases rango S | 70 | 1% | Fuerza 4 | |
| EX5 | EléctricoEléctricoElectric | 30 segundos 25 fases rango S | 70 | 1% | Fuerza 4 | |
| EX6 | FuegoFuegoFire | 1 minuto 30 fases rango S | 70 | 1% | Fuerza 4 | |
| EX7 | PlantaPlantaGrass | 1 minuto 35 fases rango S | 60 | 1% | Robaenergía | |
| EX8 | AguaAguaWater | 1 minuto y 30 segundos 40 fases rango S | 60 | 1% | Quitainterferencia + | |
| EX9 | FuegoFuegoFire | 1 minuto 45 fases rango S | 60 | 1% | Abrasivo | |
| EX10 | DragónDragónDragon | 2 minutos 50 fases rango S | 80 | 1% | Combo Dragón | |
| EX11 | PlantaPlantaGrass | 1 minuto 55 fases rango S | 70 | 1% | Robaenergía | |
| EX12 | FuegoFuegoFire | 30 segundos 60 fases rango S | 70 | 1% | Ráfaga | |
| EX13 | AguaAguaWater | 1 minuto 65 fases rango S | 70 | 1% | Ráfaga | |
| EX14 | FuegoFuegoFire | 15 segundos 70 fases rango S | 70 | 1% | Fuerza 5 | |
| EX15 | AguaAguaWater | 15 segundos 75 fases rango S | 70 | 1% | Fuerza 5 | |
| EX16 | EléctricoEléctricoElectric | 15 segundos 85 fases rango S | 70 | 1% | Fuerza 5 | |
| EX17 | FuegoFuegoFire | 2 minutos 95 fases rango S | 80 | 1% | Último Esfuerzo | |
| EX18 | HadaHadaFairy | 1 minuto 100 fases rango S | 80 | 1% | Antojo + | |
| EX19 | SiniestroSiniestroDark | 1 minuto 110 fases rango S | 80 | 1% | Fuerza 5 | |
| EX20 | PsíquicoPsíquicoPsychic | 2 minutos 150 fases rango S | 80 | 1% | Trueque | |
| EX21 | InsectoBichoBug | 2 minutos 95 fases rango S | 80 | 1% | Poder Horda | |
| EX22 | PlantaPlantaGrass | 1 minuto 100 fases rango S | 70 | 1% | Ráfaga | |
| EX23 | FuegoFuegoFire | 1 minuto 110 fases rango S | 70 | 1% | Pírico | |
| EX24 | AguaAguaWater | 2 minutos 150 fases rango S | 70 | 1% | Despiste |







