No lo he intentado, pero no veo por qué no se podría conseguir otro Magearna si reinicias tu juego, ya que es como si estuvieras jugando otro juego (partida en este caso) a pesar de que sea el mismo cartucho si lo tienes físico. Básicamente estarías borrando la partida en dónde recibiste un Magearna e iniciarías otra en dónde no lo has recibido, así que ve a jugar de nuevo si tienes dónde guardar al Magearna que ya tienes, de lo contrario sólo perderías al Magearna junto a todo tu progreso sólo para volver a sacarlo.
Si se puede tener a otro, yo tengo 4 por que me eh pasado el juego esas veces, como dato, si al hablar con la persona que te da a Magearna tienes un pokemon con la habilidad sincronia en priimer puesto, tu magearna tendra la naturaleza de este, pasa lo mismo con los zygarde , codigo cero y cosmog, menos con el munchalx de evento.