En ocasiones el problema se origina porque te conectas en horas pico, y dado el tráfico puede ocasionar fallas.
En los últimos días he visto muchos mensajes que hacen referencia a fallas en la conexión. Podrías probar conectando a horas distintas y para tratar de lograr más estabilidad podrias hacer lo siguiente:
1) Estar cerca de tu router inalámbrico. A mi cuando me falla la conexión me acerco más al router para que no vaya a darse una falla en la señal.
2) Poner el micrófono en desactivado. Esto puede ayudar a evitar que se sature demasiado la conexión.
3) Apagar temporalmente el C-gear en lo que haces el intercambio. Esto sería por la misma razón que el punto anterior.
4) Si estas intentando intercambios, a veces puede ser que uno tenga mejor recepción que el otro. En ese caso, intercambien de roles, esto es, si tu eres el que pide el intercambio en la ventanilla, deja que ahora sea la otra persona la que lo haga.
5) Por último, en ocasiones, como que no se completa bien la entrada, por lo que otra opción en que ambos salgan y vuelvan a entrar de nuevo. A mi me pasó con otra persona que me iba a pasar unos pokemon que tuvimos que entrar y salir como 5 veces, pero al final resultó, así que a veces es necesario tener un poquito de paciencia.
Creo que algunas conexiones son incompatibles, esto si no lo se con certeza, así que en realidad es más especulación.
Suerte y si no has intentado alguno de los puntos anteriores, trata. Buena suerte