IVs y Evs
Los IVs (Individual Values, o Valores Individuales) y los EVs (Effort Values, o puntos de esfuerzo) son características de un pokémon que hace que sea completamente diferente a los demás. Los IV es un puntaje del 0 al 31 en una característica, ejemplo, ataque. Si el pokémon tiene unos IVs de 31 en ataque (y una naturaleza favorable, y el máximo de EVs en ataque) quiere decir que alcanza lo máximo que puede. Los EVs son una recompensa que ganan los pokémon al derrotar a otro, por ejemplo, si derroto a Arceus, gano 3 EVs en HP, y cuando tenga 4, ¡sube el HP de mi pokémon! De hecho, las vitaminas como el calcio, suben los EVs en 10, y sirven hasta que el pokémon tenga 100. Puedes acumular 255 EVs por característica, y el máximo en total será 510 (es decir, el doble de 255, lo que nos hace sacar en conclusión que podrás tener dos características al máximo)
Naturaleza
Las naturalezas reflejan la personalidad individual de cada Pokémon. Cada Pokémon tiene una naturaleza definida y diferentes individuos de una misma especie pueden tener naturalezas diferentes.
Esta característica añade aún más variedad y diferencia entre individuos de la misma especie y mejora el metagame.
Para saber qué características suben y cuáles bajan con la naturaleza de tu Pokémon basta con echar un vistazo al tipo de letra en las estadísticas, la estadística que le sea favorable estará en un color rojo granate poco distinguible y la estadística desfavorable estará en un tono azul cielo, esto solo se aplica a los juegos Pokémon Oro HeartGold y Plata SoulSilver y a los nuevos Pokémon Negro y Blanco. Si la naturaleza es neutra, no cambiará ningún letrero. Esto es una rápida manera de saber si has encontrado la naturaleza que buscabas.
En los videojuegos de RPG de la tercera y cuarta generación podrás consultar la naturaleza de un Pokémon en la primera o segunda página respectivamente de la ficha de características, en las notas de entrenador.
Habilidad
Dentro de las novedades en Pokémon Rubí y Zafiro está la introducción de los poderes Pokémon o habilidades especiales (abilities en inglés, とくせい características esp. en japonés).
Cada especie Pokémon tiene su propia habilidad. Ésta puede servir dentro del combate o fuera de él. Se asocian a condiciones especiales en las que esa especie se desenvuelve o le favorece alguna condición especial de su cuerpo o mente.
Por ejemplo, Pikachu es un Pokémon de tipo eléctrico que tiene la habilidad de poder paralizar automáticamente a aquél que lo toque. Gastly, un Pokémon de tipo fantasma, es capaz de flotar sin necesidad de pertenecer al tipo volador gracias a su habilidad levitación, que impide que los ataques de tipo tierra le hagan daño alguno. Otra habilidad bastante común es intimidación, cuyos efectos son claros e inmediatos: disminuyen el ataque del Pokémon rival al iniciar un combate. Todos los Pokémon iniciales de todas las regiones y sus evoluciones, poseen una habilidad que aumenta los ataques de su tipo (planta, fuego o agua) cuando tienen 1/3 o menos de sus puntos de salud.